Гомологическое моделирование позволяет получить трехмерную структуру целевого белка на основе сходства между матричной и целевой последовательностями, и этот метод оказывается эффективным, когда дело доходит до изучения мембранных белков, которые трудно кристаллизовать, как GPCR, поскольку он обеспечивает более высокую степень понимания …
Что такое гомологическое моделирование и зачем оно нужно?
1.2.
Гомологическое моделирование является самым точным вычислительным методом для создания надежных структурных моделей и обычно используется во многих биологических приложениях. Моделирование гомологии предсказывает трехмерную структуру запрашиваемого белка посредством выравнивания последовательностей матричных белков.
Каков принцип моделирования гомологии?
Гомологическое моделирование также известно как сравнительное моделирование, предсказывающее структуры белков на основе гомологии последовательностей с известными структурами. Он основан на принципе, что « если два белка имеют достаточно высокое сходство последовательностей, они, вероятно, будут иметь очень похожие трехмерные структуры».
Что делает моделирование гомологии хорошим?
Если мы определим «очень успешную модель гомологии» как имеющую <=2 Å rmsd из эмпирической структуры, то шаблон должен иметь >=60% идентичности последовательности с целью для успеха частота >70% Даже при высокой идентичности последовательностей (60%-95%), каждая десятая модель гомологии имеет среднеквадратичное значение >5 Å против
Что из следующего верно о моделировании гомологии?
Объяснение: Как следует из названия, моделирование гомологии предсказывает структуры белков на основе гомологии последовательностей с известными структурами Моделирование гомологии создает модель, состоящую из всех атомов, на основе выравнивания с матричными белками.… Ошибки, допущенные на этапе выравнивания, не могут быть исправлены на следующих этапах моделирования.
