Метагеномика определяется как прямой генетический анализ геномов, содержащихся в образце из окружающей среды Эта область первоначально началась с клонирования ДНК из окружающей среды с последующим скринингом функциональной экспрессии [1], и затем был быстро дополнен прямым случайным секвенированием ДНК из окружающей среды [2, 3].
Что такое процесс метагеномики?
Метагеномика включает в себя получение ДНК от всех микроорганизмов в сообществе, не обязательно идентифицируя все задействованные виды. После секвенирования генов и их сравнения с идентифицированными последовательностями можно определить функции этих генов.
Какая методика используется в метагеномике?
Образец микробного сообщества берется из морской воды, отложений, животного-хозяина или другой морской среды обитания. Затем собранные клетки лизируют и из их лизата выделяют ДНК. Техника, которая делает возможной метагеномику, - это секвенирование дробовика, которое секвенирует случайные участки ДНК нецелевым способом.
Каковы 3 шага к изучению метагеномики?
Этапы и процесс метагеномики:
- Сборник образцов:
- Извлечение ДНК:
- Подготовка проб:
- Пробный анализ:
Как проводится функциональная метагеномика?
Функциональная метагеномика включает выделение ДНК из микробных сообществ для изучения функций кодируемых белков. Он включает в себя клонирование фрагментов ДНК, экспрессию генов в суррогатном хозяине и скрининг ферментативной активности.