BigWig - это формат файла для отображения плотных непрерывных данных в треке браузера генома, созданный путем преобразования из формата Wiggle (WIG). Формат BigWig описан на веб-сайте UCSC Genome Bioinformatics, а дополнительную информацию можно найти в руководстве по формату файлов Broad Institute.
Что такое формат bigWig?
Формат bigWig предназначен для отображения плотных, непрерывных данных, которые будут отображаться в виде графика Файлы BigWig изначально создаются из файлов типа WIG с использованием программы UCSC wigToBigWig. Кроме того, файлы bigWig могут быть созданы из файлов bedGraph с помощью программы UCSC bedGraphToBigWig.
Как использовать файл bigWig?
Переместите только что созданный файл bigWig (myBigWig.bw) на доступный в Интернете адрес http, https или ftp. Вставьте URL-адрес в форму ввода пользовательского трека или создайте собственный трек, используя одну линию трека. Вставьте линию пользовательского трека в текстовое поле на странице управления пользовательским треком.
Что такое трек bigWig?
bigWig Tracks - это треки для непрерывных сигналов по всему геному. Они подходят для отображения различных «сырых» результатов экспериментов, таких как сигналы ChIP-Seq, сигналы RNA-Seq и т. д.
Как создать файл bigWig?
Существует несколько способов создания больших файлов. Обычно это включает преобразование файла. bam в дорожку покачивания (.wig), а затем преобразование дорожки покачивания в двоичный файл bigwig (.
