BLAST - это компьютерный алгоритм, который доступен для использования в Интернете на веб-сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI), а также на многих других сайтах. BLAST может быстро выровнять и сравнить запрашиваемую последовательность ДНК с базой данных последовательностей, что делает его важным инструментом в текущих геномных исследованиях.
Является ли BLAST основной базой данных?
BLAST - наиболее широко используемое программное обеспечение в исследованиях в области биоинформатики. Его основная функция заключается в сравнении интересующей последовательности, последовательности запросов, с последовательностями в большой базе данных BLAST, а затем сообщает о лучших совпадениях или «попаданиях», найденных в базе данных. Эта простая программа имеет два основных применения.
Является ли NCBI базой данных?
NCBI содержит серию баз данных, имеющих отношение к биотехнологии и биомедицине, и является важным ресурсом для инструментов и услуг в области биоинформатики. Основные базы данных включают GenBank для последовательностей ДНК и PubMed, библиографическую базу данных для биомедицинской литературы. Другие базы данных включают базу данных NCBI Epigenomics.
Используется ли BLAST только в базах данных NCBI?
BLAST доступен в Интернете на веб-сайте NCBI. Доступны различные типы BLAST в зависимости от последовательностей запросов и целевых баз данных.
Как работает база данных BLAST?
Как работает BLAST? BLAST идентифицирует гомологичные последовательности с помощью эвристического метода, который сначала находит короткие совпадения между двумя последовательностями; таким образом, метод не принимает во внимание все пространство последовательности. После начального совпадения BLAST пытается начать локальное выравнивание с этих начальных совпадений.
